值得一提的是，汉、蜀两军交战历时之长，战况之惨烈，双方伤亡之巨大，这些都是汉军主将大司马吴汉军事生涯中所未曾遭遇过的；汉军还为此牺牲了两名著名的大将：来歙与岑彭。

因此，蜀地人民尤其是成都军民的顽强抵抗，令吴汉心中积郁了极大的仇恨。所以他一旦得势，便开始了疯狂的不顾一切的报复。何况，吴汉本身就潜藏有野兽般的残忍性格。因而，最终酿成了对成都无辜平民的大屠杀的惨剧。

吴汉率军进入成都城，不仅立即诛杀了公孙述的全家，而且更将公孙述的家族灭族，甚至还连带着使归顺的延岑一族也遭灭门。所谓“杀降不吉”，在吴汉残忍的心里，根本就没有什么意识。

吴汉大肆放纵士卒在成都城内外掳掠，焚烧宫室，摧残无辜百姓。吴汉的暴行致使成都城内血流成河，西蜀地区遭受了空前的战争浩劫，广大无辜百姓几近被杀掠一空。

这一片土地都被鲜血浸透，叫人为之哀叹，痛惜！

建武十三（公元年）年正月，吴汉振旅浮江而下，带领汉军主力撤离了蜀地。

刘秀虽然痛恨大司马吴汉的暴虐无道，但却又不得不奖赏他为平蜀所立下的赫赫功勋。

后来，当吴汉率军攻打宛县，经过他自己的家乡时，刘秀还亲自下诏准许吴汉回家祭祖，并且还赏赐了他谷米二万斛，给予他无限的恩宠和荣誉。

虽然吴汉屡有忤逆自己的命令，但是他对于刘秀的一片忠心，刘秀还是看在眼里的。

吴汉性格倔强，生性残暴。但他每每跟从刘秀征伐，非常善于揣摩刘秀的心意。只要刘秀心有不安，吴汉便都会一直侍立在他的身旁，直到刘秀安下心来，所以，吴汉一直深得刘秀的欢心和赏识。

刘秀知道，自己虽然身居帝位，但还是同常人一样，需要属下们的马屁与恭维，以满足自己的虚荣心，显示自己的非同凡品。

每次当诸将见到战阵有所不利时，大家大多惶惧失措，不知如何应对；而惟独大司马吴汉却意气自若，一边忙着修整战备，一边忙着激励将士们。

刘秀经常派人暗中查看大司马吴汉在忙些什么。使者们便总是回报说，大司马吴汉在修整战备。

因而，刘秀常常不得不感叹道：“朕的这个大司马（吴汉）虽然差强人意，但是仍不失为一难得的干城之器（隐若一敌国矣）！”

而且，吴汉一向干事勤勉。每当出师，吴汉总是朝受诏，夕即引道上路，根本就没有时间，也没有机会，考虑与料理自己的家事。他也从不拖延出军的时间，这令刘秀相当满意吴汉的兵贵神速的性格。

所以，这个吴汉虽然暴虐成性，却一直能够获得刘秀的恩宠，掌控军权，久居大司马之位。

当吴汉在朝的时候，他的行事就又显得敦厚和憨实，大智若愚，更是令刘秀放心。

当他出征在外的时候，他的妻子儿女们如果大肆购买田业，吴汉回家之后就总是会责备他们：“大军征战在外，将士们得到的赏赐还经常不足。你们为什么还要购买，霸占那么多的田宅地产呢？这不是要彰显我吴汉的私心吗？”